More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3957 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  238  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  63.48 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  63.48 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  61.02 
 
 		 116 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  60.87 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  60 
 
 		 113 aa  140  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  57.39 
 
 		 111 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  49.54 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  49.54 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  49.54 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  50.46 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  47.75 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  49.07 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  51.79 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  53.85 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  49.06 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  53.85 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  53.85 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  50.94 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  53.85 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  50.46 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  52.75 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  46.49 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  52.75 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  47.66 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  43.86 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  51.04 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  42.98 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.94 
 
 		 393 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  48.35 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  42.11 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  42.11 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.89 
 
 		 377 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  41.32 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  41.32 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.76 
 
 		 375 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.61 
 
 		 383 aa  77.4  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.16 
 
 		 395 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.94 
 
 		 392 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.93 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  46.07 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  44.94 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  44.94 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  36.84 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  45.12 
 
 		 459 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  45.12 
 
 		 459 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  45.12 
 
 		 459 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  36.84 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  46.15 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  43.82 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.21 
 
 		 383 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  43.82 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  44.87 
 
 		 459 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  36.61 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  44.87 
 
 		 459 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  44.87 
 
 		 459 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  35.92 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  40.62 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.56 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.18 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2096  rhodanese-like protein  40.86 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  46.84 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 288 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.42 
 
 		 387 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 279 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  41.76 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  35.59 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.9 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01811  rhodanese-like protein  32.2 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  35.65 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3370  glutaredoxin-like protein  39.33 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>