More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0646 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 110 aa  227  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  93.64 
 
 		 110 aa  215  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  81.82 
 
 		 110 aa  187  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  69.09 
 
 		 107 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  61.82 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  55.45 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  54.55 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  56.36 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  55.45 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  50.91 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  50 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  50.91 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  49.09 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  49.09 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  49.09 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  49.09 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  49.09 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  49.09 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  49.09 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  49.09 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  51.82 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  48.18 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  48.18 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  48.18 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  43.64 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  48.18 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  47.27 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  42.61 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  44.74 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.69 
 
 		 377 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.45 
 
 		 379 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.28 
 
 		 393 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  44.63 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  43.44 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.28 
 
 		 383 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  36.44 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.44 
 
 		 361 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  43.52 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.96 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.89 
 
 		 383 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.01 
 
 		 395 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  46.59 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.76 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.32 
 
 		 386 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  35.92 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  37.72 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  48.1 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  34.55 
 
 		 368 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  34.55 
 
 		 368 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.64 
 
 		 392 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  34.19 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  35.19 
 
 		 377 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  33.63 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.2 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  33.63 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  44.3 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  45.45 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.67 
 
 		 386 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  32.5 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  35.19 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  38.64 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  37.36 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  34.21 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  34.29 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  34.29 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  34.29 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  43.96 
 
 		 460 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>