More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2027 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 112 aa  230  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  230  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  76.79 
 
 		 111 aa  169  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  71.55 
 
 		 116 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  63.48 
 
 		 115 aa  151  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  62.83 
 
 		 113 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  56.67 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  52.89 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  52.83 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  52.83 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  52.83 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  46.3 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  52.43 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  51.89 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  51.43 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  51.43 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  51.43 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  52.43 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  52.43 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  52.43 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  52.43 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  52.43 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  47.12 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  50.49 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  51.46 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  51.46 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  49.51 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  48.54 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  45.05 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  54.74 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  51.65 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  45.87 
 
 		 105 aa  93.6  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  43.12 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  44.14 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  47.78 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.79 
 
 		 375 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  41.28 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  43.12 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  41.28 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.28 
 
 		 383 aa  83.6  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.28 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.83 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.78 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.71 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.05 
 
 		 393 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.53 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.19 
 
 		 392 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  35.96 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  35.96 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  38.26 
 
 		 459 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  38.26 
 
 		 459 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  45.54 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  38.26 
 
 		 459 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  36.52 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 459 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 459 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  42.22 
 
 		 377 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 284 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 		 459 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  34.23 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  41.76 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  34.23 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  38.53 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  43.52 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  43.52 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  42.71 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  41.94 
 
 		 308 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  41.94 
 
 		 308 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  36.56 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  36.11 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  37.27 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  41.3 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  46.84 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.57 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.45 
 
 		 390 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  35.96 
 
 		 388 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  41.94 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  40.7 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  39.33 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>