More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1035 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  100 
 
 
106 aa  221  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  80.19 
 
 
106 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  54.72 
 
 
106 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  55.14 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  52.34 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  52.83 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  50.47 
 
 
107 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  48.6 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  48.6 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  46.73 
 
 
107 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  48.6 
 
 
107 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  46.73 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  47.66 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  48.6 
 
 
107 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 
107 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  47.66 
 
 
107 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  47.66 
 
 
107 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  47.66 
 
 
107 aa  103  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  47.66 
 
 
107 aa  103  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 
107 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 
109 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  46.73 
 
 
107 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  46.73 
 
 
107 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  46.73 
 
 
107 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  46.73 
 
 
107 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  50.91 
 
 
110 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  43.86 
 
 
115 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  50 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  48.18 
 
 
110 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  44.55 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  45.79 
 
 
107 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  39.42 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.81 
 
 
377 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.81 
 
 
393 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  42.02 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  44.92 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  42.59 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  42.2 
 
 
112 aa  89.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.51 
 
 
379 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  41.28 
 
 
112 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  41.28 
 
 
112 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  38.05 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.96 
 
 
375 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  40.71 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  37.96 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  38.46 
 
 
377 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.46 
 
 
392 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.54 
 
 
383 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  47.67 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.77 
 
 
390 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  46.75 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.54 
 
 
383 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.16 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.89 
 
 
390 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.74 
 
 
361 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.24 
 
 
392 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  36.54 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  40 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  35.87 
 
 
280 aa  67  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.33 
 
 
395 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.08 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.24 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  37 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.84 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  39.53 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  45.33 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.08 
 
 
399 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  36.17 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.45 
 
 
390 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  40.79 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  42.05 
 
 
389 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.19 
 
 
400 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.91 
 
 
393 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.19 
 
 
400 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>