More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2112 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
114 aa  235  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  85.96 
 
 
134 aa  204  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  40.57 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  43.93 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  45.79 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.57 
 
 
390 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 
116 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.42 
 
 
375 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  42 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  44.66 
 
 
390 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  35.34 
 
 
119 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  40.95 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  38.18 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  43.48 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.31 
 
 
392 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.75 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.75 
 
 
387 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  37.14 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  45.35 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  45.35 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  45.35 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  45.35 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  43.62 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  44.19 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.53 
 
 
398 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  41.35 
 
 
308 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  44.19 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  44.19 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  43.02 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  43.02 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  43.02 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.79 
 
 
377 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.05 
 
 
392 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.17 
 
 
383 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.19 
 
 
386 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.14 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2096  rhodanese-like protein  41.3 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  42.39 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  41.3 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  42.71 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.43 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  39.8 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
392 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  39.58 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  42.59 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  46.07 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.98 
 
 
390 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
361 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.11 
 
 
383 aa  70.5  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  40.7 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  42.71 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  44.94 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  37 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.01 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  45.83 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  42.71 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  41.86 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.11 
 
 
393 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  41.86 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.79 
 
 
395 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  37.21 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.63 
 
 
383 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.61 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.53 
 
 
386 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  42.71 
 
 
118 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  34.69 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.32 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  41.41 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.24 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16081  rhodanese-like protein  40 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.24 
 
 
400 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.24 
 
 
400 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.24 
 
 
400 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
558 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.45 
 
 
393 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  34.04 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  33.67 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  33.67 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  33.67 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  33.67 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  40.19 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>