More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1757 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
134 aa  282  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  85.96 
 
 
114 aa  204  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  42.45 
 
 
107 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.51 
 
 
390 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  49.51 
 
 
390 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  46.67 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  43.1 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.6 
 
 
390 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.35 
 
 
375 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  41.9 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  42.99 
 
 
112 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 
119 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 
119 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.23 
 
 
392 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  39.13 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.66 
 
 
387 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  43.81 
 
 
106 aa  85.5  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  41.07 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  46.81 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  47.67 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  47.67 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  47.67 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  45.74 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  49.44 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  47.67 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  44.68 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  44.68 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  40 
 
 
308 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  44.68 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.05 
 
 
398 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.45 
 
 
383 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.95 
 
 
392 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.05 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  47.19 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  45.56 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  44.09 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  43.62 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 
383 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  43.62 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.62 
 
 
395 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40 
 
 
392 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  45.35 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.95 
 
 
390 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.14 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  40.22 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.7 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  45.35 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  41.86 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  34.95 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.98 
 
 
390 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  39.33 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 
393 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.1 
 
 
390 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
220 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  37.21 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  38 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  42.39 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  36.36 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  43.52 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  35.78 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  39.8 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  32.67 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.14 
 
 
397 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.14 
 
 
386 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  38.54 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  37.27 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.86 
 
 
383 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2096  rhodanese-like protein  39.13 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  38.6 
 
 
423 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 
361 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  34.17 
 
 
308 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  39.64 
 
 
391 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.38 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.1 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  37.14 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  34.17 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
399 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  42.42 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  37.23 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  44.68 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  38.18 
 
 
387 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>