More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2634 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
105 aa  214  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  57.69 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.44 
 
 
392 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  48.51 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  47.47 
 
 
116 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.19 
 
 
379 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  47.92 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  47.37 
 
 
97 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 
269 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.21 
 
 
375 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.22 
 
 
390 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.24 
 
 
390 aa  84.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.16 
 
 
392 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  52.78 
 
 
345 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.14 
 
 
393 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  46.81 
 
 
220 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.78 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  42.27 
 
 
390 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  39.81 
 
 
368 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  39.81 
 
 
368 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.21 
 
 
348 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  41.05 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.21 
 
 
390 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  44.58 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.18 
 
 
398 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  43.37 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.6 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.24 
 
 
390 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  37.25 
 
 
393 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  38.89 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.24 
 
 
386 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 
278 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.18 
 
 
393 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.18 
 
 
393 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  50 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  42.17 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.25 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  36.19 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  36 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  42.17 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  43.75 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  43.75 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.14 
 
 
387 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  43.75 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  34.58 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.43 
 
 
566 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.43 
 
 
566 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  40.57 
 
 
378 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  41.35 
 
 
389 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.89 
 
 
377 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  48.75 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  42.2 
 
 
388 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  35.11 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
290 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
271 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.58 
 
 
395 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  38 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  40 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  41.28 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.2 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  39.78 
 
 
565 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.22 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.22 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 
480 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.46 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.71 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.14 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  40.91 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  37.37 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  39 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40.82 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 
480 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  42.39 
 
 
711 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>