More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0337 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  56.99 
 
 		 288 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1871  Rhodanese domain protein  49.4 
 
 		 342 aa  292  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  38.43 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  33.82 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  31.5 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  31.84 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  41.35 
 
 		 105 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 		 102 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 104 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  42.53 
 
 		 138 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  44.87 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  36.79 
 
 		 141 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  38.95 
 
 		 105 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  43.21 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  37.78 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  41.77 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41 
 
 		 98 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 106 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  37.27 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  38.78 
 
 		 711 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  39.05 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  41.3 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  39.02 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 		 98 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  37.37 
 
 		 98 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  37.37 
 
 		 98 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  42.35 
 
 		 189 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  44.05 
 
 		 170 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 119 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.14 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.02 
 
 		 123 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  35.24 
 
 		 118 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 114 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  34.26 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  38.54 
 
 		 102 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 102 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 102 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 103 aa  63.9  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  41.25 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  41.25 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 		 106 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.82 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 		 98 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  37 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.56 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.05 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  43.9 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.2 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.68 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 116 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  42.11 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  34.34 
 
 		 127 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  42.11 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  34.55 
 
 		 177 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  39.53 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  33.02 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  34.34 
 
 		 127 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>