More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0928 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  246  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  84.38 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  70.31 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  67.97 
 
 		 135 aa  176  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  64.57 
 
 		 135 aa  173  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  67.97 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  64.57 
 
 		 135 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  63.78 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  67.19 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  55.47 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  55.47 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  54.62 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  50.38 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  48.03 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  45.67 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  46.03 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  51.16 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  46.03 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  46.03 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.52 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  41.73 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  42.52 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.41 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  43.65 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  43.65 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  44.64 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  44.64 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  41.73 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.9 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  40.59 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  40.59 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  36.51 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  34.96 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  40.2 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  35.66 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  42.27 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  40.22 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  32.2 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  32.2 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  32.2 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  32.2 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  36.27 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  45.05 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.68 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  46.25 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  38.75 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.45 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>