More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2561 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  100 
 
 		 288 aa  590  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  47.44 
 
 		 282 aa  262  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 279 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  43.25 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  30.99 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  32.6 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  30.32 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 129 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  50.57 
 
 		 129 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  31.84 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  31.54 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  29.15 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 459 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.91 
 
 		 189 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  45.98 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  44.44 
 
 		 820 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1871  Rhodanese domain protein  27.54 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  45.88 
 
 		 459 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  45.88 
 
 		 459 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  45.88 
 
 		 459 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  50.65 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  46.25 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  46.75 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 		 459 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  37.07 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 		 459 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  42.53 
 
 		 138 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  44.58 
 
 		 711 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 		 124 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 121 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 		 124 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 123 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.62 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  36.54 
 
 		 685 aa  75.9  0.0000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  46.25 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  41.03 
 
 		 470 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  48.1 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  39.18 
 
 		 118 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  48 
 
 		 105 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.18 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  47.3 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  41.67 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  48.72 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.57 
 
 		 548 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000142725  normal  0.651918 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 478 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 478 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  42.17 
 
 		 711 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 484 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.05 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 484 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 		 478 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  42.31 
 
 		 476 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  47.3 
 
 		 106 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  35 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.26 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  43.24 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  35 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  35.79 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  35 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  35.79 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  35 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 		 109 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  45 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  35 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  35 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.57 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  35 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  35.79 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  46.84 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  46.84 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  33.66 
 
 		 119 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.27 
 
 		 831 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  40.54 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  42.68 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40.54 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.58 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  44.16 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  44.16 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  34.65 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  37.76 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>