More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2623 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  45.28 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  46.67 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  40.54 
 
 		 685 aa  104  4e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  45.71 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  42.45 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  38.66 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  42.99 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 		 116 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  43.48 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.42 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  48.65 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  33.12 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  40.57 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  51.52 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 		 179 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  31.37 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.53 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  39.29 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  37.17 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.17 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  35.29 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  38.46 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  35.14 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.17 
 
 		 455 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.19 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  37.14 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 470 aa  70.5  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.11 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.63 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.61 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  38 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.61 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.74 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.46 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  34.55 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 469 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 184 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  40.26 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  50.82 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 225 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  35.51 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  29.84 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  32.65 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  38.64 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  38.16 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  40.26 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.34 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  30.61 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  29.31 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>