More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1792 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  100 
 
 
177 aa  364  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  62.01 
 
 
185 aa  223  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  47.7 
 
 
181 aa  148  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  46.71 
 
 
175 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  47.06 
 
 
174 aa  144  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  47.06 
 
 
174 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  46.95 
 
 
178 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  46.41 
 
 
174 aa  141  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  46.41 
 
 
174 aa  141  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  46.41 
 
 
174 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  46.41 
 
 
174 aa  140  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  46.41 
 
 
174 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  47.71 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  47.71 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  43.45 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  47.71 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  47.71 
 
 
175 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  47.06 
 
 
175 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  44.74 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  45.39 
 
 
173 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  45.1 
 
 
174 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  42.94 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  46.1 
 
 
194 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 
218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  40.88 
 
 
190 aa  124  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  43.04 
 
 
168 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 
192 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  43.53 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  43.35 
 
 
225 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  43.35 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.85 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  38.86 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  38.8 
 
 
197 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.8 
 
 
197 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  42.86 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  41.21 
 
 
204 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 
176 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
194 aa  103  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  37.87 
 
 
199 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  37.06 
 
 
198 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
190 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 
197 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  33.52 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42.16 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 
269 aa  81.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  44.44 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  44.44 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  43.12 
 
 
107 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.4 
 
 
216 aa  79  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  47.62 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  48.28 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  42.86 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  44.76 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 
113 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40.95 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  40.57 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.93 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  37.4 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.62 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38.46 
 
 
151 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  46.07 
 
 
108 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
140 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
118 aa  72  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  35.58 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  43.01 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 
108 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  43.81 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  40.86 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  40.7 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  40.82 
 
 
390 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  36.84 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
110 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  44.59 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  44.59 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  44.59 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  44.59 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  40.19 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  44.59 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  37.62 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.77 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  44.59 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>