More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0218 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  100 
 
 
124 aa  253  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  93.69 
 
 
124 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  67.5 
 
 
127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  72.73 
 
 
127 aa  180  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  69.03 
 
 
127 aa  176  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  53.64 
 
 
128 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  53.64 
 
 
128 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1098  rhodanese-like domain-containing protein  52.88 
 
 
128 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.50034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1382  rhodanese-related sulfurtransferase  46.43 
 
 
132 aa  106  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000754094  hitchhiker  0.000000000000041245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1205  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 
137 aa  100  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0472  rhodanese-like domain-containing protein  42.02 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.71 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  50.63 
 
 
277 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  48.35 
 
 
102 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  46.46 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  50.68 
 
 
565 aa  84  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.17 
 
 
141 aa  83.6  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  44.3 
 
 
279 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
463 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  44.59 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  45.95 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  47.37 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  47.5 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  43.59 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.21 
 
 
566 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.21 
 
 
566 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  47.44 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  43.02 
 
 
288 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  38 
 
 
284 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  35.14 
 
 
280 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  37.63 
 
 
127 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  47.25 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  43.33 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  42.5 
 
 
820 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  48.19 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.54 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  38.54 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.34 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  44.3 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 
282 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32.2 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  50 
 
 
554 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 
356 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  50 
 
 
554 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  50 
 
 
554 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.05 
 
 
389 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.67 
 
 
562 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  50 
 
 
554 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  50 
 
 
554 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  38.27 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  43.37 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  37.63 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  50 
 
 
554 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  46.91 
 
 
554 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  38.83 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  43.75 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.57 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  42.47 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
356 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>