More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2349 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 
145 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 
142 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
141 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  38.64 
 
 
141 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
141 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  34.75 
 
 
144 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  35.46 
 
 
144 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
144 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
144 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
158 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  34.04 
 
 
144 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  37.41 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
144 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.96 
 
 
138 aa  98.2  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  34.04 
 
 
144 aa  94.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.62 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  33.58 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  36.17 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  36.17 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  36.17 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 
143 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  36.88 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  36.88 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  32.62 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  32.62 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  32.62 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 
144 aa  92  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 
170 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  32.62 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.23 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  32.62 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  30.5 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  38.69 
 
 
173 aa  87.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 
123 aa  86.7  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  33.09 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  33.09 
 
 
140 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 
140 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 
140 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  34.07 
 
 
149 aa  84.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.81 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  36.27 
 
 
151 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  33.09 
 
 
141 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 
161 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  35.82 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  38.61 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  30.82 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  37.37 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  40 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  32.37 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  34.33 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  27.86 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.91 
 
 
269 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  32.37 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  35.07 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31.88 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31.88 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31.88 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31.88 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  28.37 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  30.5 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31.88 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  28.37 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  33.82 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31.88 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  41.18 
 
 
229 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>