More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1742 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  219  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  57.55 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  55.66 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  54.72 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  55.14 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  56.84 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  57.89 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  57.89 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  54.21 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  57.89 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  57.89 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  57.89 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  57.89 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  54.21 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  54.21 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  54.21 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  54.21 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  53.27 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  52.34 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  52.34 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  52.34 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  56.84 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  56.84 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  53.27 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  53.27 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  52.34 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  51.79 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  50.5 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.52 
 
 		 393 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.62 
 
 		 377 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  52.17 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  47.12 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  48.18 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  51.65 
 
 		 112 aa  95.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  51.65 
 
 		 112 aa  95.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  48.18 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  47.22 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  45.87 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  45.79 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  44.54 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  47.19 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.4 
 
 		 383 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.27 
 
 		 383 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  44.92 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  44.9 
 
 		 377 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  50 
 
 		 377 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.72 
 
 		 375 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.99 
 
 		 361 aa  86.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  45 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  43.81 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  45.45 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  51.85 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  43.86 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.95 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.68 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.51 
 
 		 395 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  43 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.05 
 
 		 392 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  47.67 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 		 269 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  41.3 
 
 		 189 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  47.19 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  46.25 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02371  rhodanese-like protein  37.84 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01801  rhodanese-like protein  38.66 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0504917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 279 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 		 220 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  46.59 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.68 
 
 		 386 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1530  rhodanese-like  36.94 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.251959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  48.65 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2416  rhodanese-like protein  40 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  48.65 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.46 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  48.65 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.5 
 
 		 390 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  46.99 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.49 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  43.01 
 
 		 461 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.95 
 
 		 550 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  36.94 
 
 		 378 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>