More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1308 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  100 
 
 
271 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  40.07 
 
 
288 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  38.43 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1871  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 
342 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 
278 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.73 
 
 
280 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  32.27 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  30.31 
 
 
279 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
282 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  31.54 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 
145 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 
123 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  47.87 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  41.76 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  42.7 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.77 
 
 
189 aa  79  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.12 
 
 
568 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 
125 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.56 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.74 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  41 
 
 
105 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 
112 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 
121 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 
113 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  39.56 
 
 
820 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  39.77 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  46.75 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  46.75 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 
121 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 
141 aa  72  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  32.17 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  37.8 
 
 
118 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  33.33 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
124 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
141 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  48.05 
 
 
711 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.18 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  42.35 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  43.75 
 
 
470 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.38 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  38.1 
 
 
105 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  40.23 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.17 
 
 
817 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  44.3 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.44 
 
 
566 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.44 
 
 
566 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.04 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  48.72 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  40.59 
 
 
711 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
550 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  32.46 
 
 
387 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  41.56 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  37.23 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.05 
 
 
478 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  42.5 
 
 
461 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  44.87 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.66 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
480 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.05 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  35.05 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.05 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.05 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.78 
 
 
173 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  35.87 
 
 
170 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  43.42 
 
 
109 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.56 
 
 
110 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  44.32 
 
 
118 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  34.57 
 
 
127 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.05 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 
102 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 
114 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
98 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  40.23 
 
 
106 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 
104 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.42 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
150 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.38 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>