More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5355 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  96.07 
 
 		 356 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  96.63 
 
 		 356 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  90.45 
 
 		 356 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  96.07 
 
 		 356 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  97.75 
 
 		 356 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  96.07 
 
 		 356 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  75.99 
 
 		 357 aa  564  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  76.55 
 
 		 357 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  44.29 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  51.71 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  52 
 
 		 229 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  42.74 
 
 		 344 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  42.42 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  50.65 
 
 		 232 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  41.19 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  41.69 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  50.22 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  49.57 
 
 		 249 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  50.22 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  48.47 
 
 		 242 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  47.62 
 
 		 233 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  49.12 
 
 		 233 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  49.12 
 
 		 233 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  49.56 
 
 		 229 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  48.71 
 
 		 249 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  45.27 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  49.56 
 
 		 229 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 249 aa  212  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  44.74 
 
 		 229 aa  212  9e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  47.37 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  47.37 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  48.93 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  48.48 
 
 		 232 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  44.12 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  52.19 
 
 		 239 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  46.84 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  44.54 
 
 		 250 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  49.13 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  49.13 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  47.64 
 
 		 230 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  46.35 
 
 		 245 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  46.96 
 
 		 249 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  46.35 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  43.35 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.92 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  40.87 
 
 		 235 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  40.87 
 
 		 235 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.61 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 308 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  36.84 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  35.71 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 266 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.97 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  32.84 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  34.2 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  31.18 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  33.21 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  31.56 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  32.58 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  31.56 
 
 		 288 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  29.39 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  30.4 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  27.73 
 
 		 761 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  32.46 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  28.32 
 
 		 778 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  31.32 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 220 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 215 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 294 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 307 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 		 208 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  29.83 
 
 		 759 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  46.43 
 
 		 186 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 306 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.71 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.84 
 
 		 209 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  32.95 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  30.19 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  30.99 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  30.92 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  30.99 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  29.92 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>