More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3647 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  100 
 
 		 294 aa  611  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  88.44 
 
 		 294 aa  557  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2816  beta-lactamase-like  71.48 
 
 		 293 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104753  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  67.35 
 
 		 295 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  68.88 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6795  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  69.36 
 
 		 297 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  66.21 
 
 		 295 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3688  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  66.55 
 
 		 295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  61.54 
 
 		 293 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  63.16 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  62.81 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  60.84 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  60.78 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3744  beta-lactamase domain-containing protein  59.36 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2535  beta-lactamase-like  59.09 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  58.82 
 
 		 289 aa  361  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  60.28 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  57.88 
 
 		 292 aa  352  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  57.75 
 
 		 288 aa  348  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  55.09 
 
 		 307 aa  346  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  56.14 
 
 		 288 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  56.14 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  55.44 
 
 		 288 aa  341  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  56.34 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  55.24 
 
 		 293 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  54.24 
 
 		 297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2372  beta-lactamase-like protein  54.64 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000610112  hitchhiker  0.0000246609 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  55.14 
 
 		 307 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  55.14 
 
 		 294 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4665  beta-lactamase domain protein  54.23 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168284  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  55.14 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  55.75 
 
 		 294 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  55.94 
 
 		 294 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  56.34 
 
 		 286 aa  331  8e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  55.59 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  53.66 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  54.51 
 
 		 293 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  53.66 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  53.66 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  53.66 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  53.66 
 
 		 294 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  52.96 
 
 		 289 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  52.56 
 
 		 306 aa  328  7e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  54.67 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  54.9 
 
 		 294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  52.1 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  53.98 
 
 		 289 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  54.04 
 
 		 286 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  51.06 
 
 		 290 aa  318  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  54.2 
 
 		 296 aa  318  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.3 
 
 		 294 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  52.61 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6239  beta-lactamase domain-containing protein  53.15 
 
 		 286 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  52.08 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1705  beta-lactamase domain protein  51.94 
 
 		 286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.739327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1544  hypothetical protein  50.88 
 
 		 286 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1299  putative metallo-beta-lactamase family protein  50.35 
 
 		 286 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2013  beta-lactamase domain protein  51.59 
 
 		 286 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  50 
 
 		 287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  50.17 
 
 		 432 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  52.61 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  53.7 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  48.11 
 
 		 307 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  50.53 
 
 		 303 aa  298  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3460  Beta-lactamase-like  49.12 
 
 		 287 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  48.6 
 
 		 296 aa  295  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3366  beta-lactamase-like  47.54 
 
 		 316 aa  295  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  49.47 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  52.22 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  48.77 
 
 		 303 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  48.77 
 
 		 302 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  49.12 
 
 		 289 aa  291  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  48.45 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  50.7 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  48.42 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  47.95 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  50.17 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  46.83 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  47.54 
 
 		 431 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.07 
 
 		 439 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  46.48 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  47.02 
 
 		 296 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  46.13 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  47.42 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  48.41 
 
 		 426 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3205  beta-lactamase domain-containing protein  50.17 
 
 		 290 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.568485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  47.16 
 
 		 426 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.39 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  44.01 
 
 		 290 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2067  beta-lactamase-like  46.34 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  0.239131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  44.64 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  44.48 
 
 		 297 aa  254  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1978  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  42.81 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1647  beta-lactamase domain protein  42.31 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  46.95 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>