More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1103 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
239 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  70.48 
 
 
228 aa  328  7e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  55.51 
 
 
249 aa  263  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  53.81 
 
 
244 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  57.45 
 
 
232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  55.07 
 
 
361 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  59.21 
 
 
229 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  59.21 
 
 
229 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  52.1 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  51.46 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  56.39 
 
 
242 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  55.79 
 
 
250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  55.11 
 
 
229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  53.33 
 
 
250 aa  237  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  53.33 
 
 
250 aa  237  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  51.26 
 
 
249 aa  235  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  53.02 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  49.56 
 
 
229 aa  227  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  51.09 
 
 
230 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  51.09 
 
 
230 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  49.37 
 
 
250 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  52.42 
 
 
233 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  51.11 
 
 
239 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  52.63 
 
 
356 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  50.81 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 
356 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 
356 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  53.07 
 
 
232 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  49.79 
 
 
357 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  51.75 
 
 
356 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  46.84 
 
 
250 aa  218  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  49.4 
 
 
248 aa  218  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  46.41 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 
356 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 
356 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  51.54 
 
 
230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  52.19 
 
 
356 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.06 
 
 
357 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  47.79 
 
 
346 aa  204  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  47.79 
 
 
345 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  47.35 
 
 
346 aa  201  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  43.36 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  43.36 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  46.26 
 
 
233 aa  198  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  46.26 
 
 
233 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  47.35 
 
 
344 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  43.53 
 
 
233 aa  188  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  41.85 
 
 
354 aa  177  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  42.73 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  36.86 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  52.59 
 
 
186 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  33.21 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  34.31 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 
298 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  32.58 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.77 
 
 
293 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 
301 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  34.55 
 
 
307 aa  121  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
288 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  32.97 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 
289 aa  119  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.91 
 
 
292 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 
266 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  30.55 
 
 
294 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  30.57 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2470  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
315 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  33.21 
 
 
308 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  33.95 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  32.85 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  32.29 
 
 
297 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
289 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 
294 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 
244 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 
300 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  32.28 
 
 
307 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 
251 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4599  Beta-lactamase-like  31.5 
 
 
290 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
205 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  31.27 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
484 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  31.64 
 
 
295 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
297 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  30.18 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
310 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
294 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 
307 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 
320 aa  112  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
244 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
289 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  33.63 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 
205 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>