More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2007 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 361 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  66.96 
 
 		 232 aa  315  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  46.13 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  57.96 
 
 		 229 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  57.96 
 
 		 229 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  44.57 
 
 		 356 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  54.43 
 
 		 245 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  44.17 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  44.29 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  56.22 
 
 		 248 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  44.44 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  41.32 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  55.32 
 
 		 258 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.06 
 
 		 357 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  40.72 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  54.19 
 
 		 233 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  41.27 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  53.33 
 
 		 242 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  54.87 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  40.17 
 
 		 345 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  53.74 
 
 		 230 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  53.74 
 
 		 230 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  41.94 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  54.08 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  55.07 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  49.36 
 
 		 235 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  50.85 
 
 		 244 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  51.5 
 
 		 249 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  55.07 
 
 		 229 aa  236  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  48.93 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  54.24 
 
 		 250 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  52.44 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  50 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  49.79 
 
 		 249 aa  225  8e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.08 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  49.56 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  49.56 
 
 		 233 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  51.54 
 
 		 230 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  49.15 
 
 		 250 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  49.15 
 
 		 250 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  48.7 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  45.96 
 
 		 249 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  44.58 
 
 		 250 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  35.59 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  46.7 
 
 		 229 aa  202  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  44.62 
 
 		 250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  45.89 
 
 		 250 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 		 244 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  42.47 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 215 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 		 298 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  35.34 
 
 		 299 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  34.59 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 		 288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  30.97 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 467 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  31.95 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  32.96 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 307 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0869  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 293 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  33.96 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2599  beta-lactamase-like protein  33.07 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.398992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0946  beta-lactamase-like  33.08 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4706  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.10936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  32.06 
 
 		 293 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 471 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  31.64 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  33.59 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4146  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4060  hypothetical protein  32.53 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  30.56 
 
 		 432 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.51 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5566  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  31.68 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  37.24 
 
 		 214 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3837  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  31.06 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1205  beta-lactamase-like  31.96 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10471  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 202 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 296 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2701  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 		 320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 304 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  31.06 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>