More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0735 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  62.93 
 
 
205 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  56.8 
 
 
207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  53.4 
 
 
207 aa  230  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  55.17 
 
 
205 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  52.43 
 
 
213 aa  225  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  53.66 
 
 
210 aa  225  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  51.22 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  51.22 
 
 
211 aa  220  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 
209 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  51.49 
 
 
210 aa  209  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  47.34 
 
 
209 aa  201  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  47.83 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  45.15 
 
 
213 aa  197  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  48.06 
 
 
206 aa  194  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  47.57 
 
 
206 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  46 
 
 
201 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  47.12 
 
 
209 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  45.63 
 
 
251 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  45.67 
 
 
209 aa  184  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  45.67 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  46.57 
 
 
210 aa  182  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  45.67 
 
 
207 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 
211 aa  181  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  43 
 
 
215 aa  181  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  43.14 
 
 
216 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  45.02 
 
 
209 aa  177  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  44.5 
 
 
215 aa  177  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  44.5 
 
 
215 aa  177  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  44.5 
 
 
215 aa  177  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  44.5 
 
 
215 aa  177  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  44.02 
 
 
215 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  44.5 
 
 
215 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  44.5 
 
 
215 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  44.02 
 
 
215 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  44.71 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  43.33 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  44.33 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  42.79 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  43.27 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
214 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  44.23 
 
 
214 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  42.79 
 
 
214 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  43.84 
 
 
212 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
214 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  45.19 
 
 
214 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  43 
 
 
214 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  43 
 
 
214 aa  168  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  44.33 
 
 
213 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  41.15 
 
 
215 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  42.86 
 
 
222 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  42.29 
 
 
198 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  42.36 
 
 
213 aa  165  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  41.46 
 
 
213 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  42.79 
 
 
214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  41.35 
 
 
237 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  41.35 
 
 
241 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  43.4 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  43.63 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 
209 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  42.47 
 
 
215 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  42.31 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3586  metallo-beta-lactamase family protein  43.54 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 
215 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  38.42 
 
 
208 aa  161  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  42.36 
 
 
216 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  42.16 
 
 
222 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  41.9 
 
 
218 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  42.86 
 
 
215 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 
209 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
209 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.35 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.38 
 
 
215 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 
209 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 
215 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 
240 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 
209 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 
209 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  41.67 
 
 
214 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  40.87 
 
 
214 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
214 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>