More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6622 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
357 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  80.67 
 
 
357 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  76.55 
 
 
356 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  76.55 
 
 
356 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  75.71 
 
 
356 aa  557  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  76.55 
 
 
356 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  76.27 
 
 
356 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  75.71 
 
 
356 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  75.71 
 
 
356 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  43.06 
 
 
361 aa  262  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  55.32 
 
 
258 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  55.31 
 
 
229 aa  249  6e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  39.72 
 
 
344 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  39.17 
 
 
345 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  48.5 
 
 
249 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  48.13 
 
 
249 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  48.05 
 
 
232 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  39.61 
 
 
346 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.78 
 
 
239 aa  222  9e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  38.5 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  47.6 
 
 
242 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  48.52 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  46.38 
 
 
233 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  49.78 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  44.3 
 
 
229 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  47.37 
 
 
233 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  47.37 
 
 
233 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  48.25 
 
 
250 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  47.23 
 
 
250 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  47.23 
 
 
250 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  45.18 
 
 
230 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  44.26 
 
 
250 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.18 
 
 
230 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  51.06 
 
 
239 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  46.09 
 
 
244 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  46.32 
 
 
232 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  45.61 
 
 
250 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  47.37 
 
 
229 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  47.37 
 
 
229 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  47.03 
 
 
248 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  45.76 
 
 
245 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  45.69 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  45.73 
 
 
233 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  42.08 
 
 
250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  43.12 
 
 
249 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.33 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  38.26 
 
 
235 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  38.26 
 
 
235 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.65 
 
 
354 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  31.7 
 
 
297 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  29.06 
 
 
759 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 
289 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  27.91 
 
 
778 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  32.95 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
289 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  26.35 
 
 
761 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  30.04 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  47.14 
 
 
186 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
294 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  31.82 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  31.06 
 
 
298 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 
215 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
296 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 
294 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  30.04 
 
 
288 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 
289 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0571  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 
290 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 
244 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  34.85 
 
 
291 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01930  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 
287 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  31 
 
 
292 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 
266 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  30.04 
 
 
288 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0473  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 
308 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1981  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
289 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 
215 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  29.32 
 
 
299 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  29.21 
 
 
293 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  28.73 
 
 
294 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
288 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  30.86 
 
 
308 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
206 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  28.36 
 
 
294 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 
210 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  26.7 
 
 
771 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  31.14 
 
 
297 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 
288 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2757  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
307 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 
251 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  31.45 
 
 
294 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 
294 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
202 aa  100  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1921  beta-lactamase-like  30.19 
 
 
297 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 
294 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
298 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 
209 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>