More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0838 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  100 
 
 		 778 aa  1619    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  61.41 
 
 		 761 aa  977    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  64.24 
 
 		 759 aa  1027    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  54.15 
 
 		 753 aa  835    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  61.44 
 
 		 771 aa  973    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  33.85 
 
 		 384 aa  211  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  32.81 
 
 		 384 aa  208  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  35.19 
 
 		 380 aa  205  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  35.19 
 
 		 380 aa  205  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  34.9 
 
 		 396 aa  200  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  34.21 
 
 		 382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  31.3 
 
 		 380 aa  193  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  34.09 
 
 		 400 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4203  aminotransferase, class V  35.86 
 
 		 382 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  33.6 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  33.07 
 
 		 398 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  33.95 
 
 		 400 aa  190  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  32.37 
 
 		 380 aa  190  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.21 
 
 		 398 aa  190  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  33.24 
 
 		 381 aa  189  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  35.19 
 
 		 402 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  31.51 
 
 		 383 aa  187  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  31.03 
 
 		 380 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  34.33 
 
 		 408 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  31.22 
 
 		 384 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  35.77 
 
 		 404 aa  186  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  30.79 
 
 		 407 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 373 aa  185  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  31.3 
 
 		 398 aa  185  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  33.67 
 
 		 382 aa  185  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  31.49 
 
 		 388 aa  185  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.42 
 
 		 400 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0006  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 384 aa  184  4.0000000000000006e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  31.84 
 
 		 380 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  34.99 
 
 		 404 aa  183  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  35.9 
 
 		 407 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  31.05 
 
 		 381 aa  183  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  32.06 
 
 		 393 aa  183  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  32.98 
 
 		 379 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  34.84 
 
 		 407 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 380 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  34.07 
 
 		 405 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  34.81 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  31.79 
 
 		 385 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  35.25 
 
 		 404 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 380 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 380 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  33.5 
 
 		 403 aa  181  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 380 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 380 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.03 
 
 		 396 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 380 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 404 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 404 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 404 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  32.74 
 
 		 380 aa  181  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 404 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  31.58 
 
 		 380 aa  181  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  35.31 
 
 		 390 aa  181  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  32.35 
 
 		 401 aa  180  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  31.32 
 
 		 380 aa  180  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  31.74 
 
 		 387 aa  180  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 404 aa  180  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  32.03 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  32.37 
 
 		 398 aa  179  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  33.65 
 
 		 407 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  33.65 
 
 		 407 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  33.16 
 
 		 391 aa  178  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0304  aminotransferase, class V  34.01 
 
 		 395 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0835  aminotransferase class V  35.22 
 
 		 377 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.723233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  34.09 
 
 		 407 aa  179  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  31.85 
 
 		 380 aa  178  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  31.84 
 
 		 401 aa  178  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  31.3 
 
 		 373 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3007  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 378 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  31.3 
 
 		 373 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  31.89 
 
 		 377 aa  177  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  33.94 
 
 		 405 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  31.3 
 
 		 373 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  31.3 
 
 		 373 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  34.47 
 
 		 405 aa  177  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 381 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  31.3 
 
 		 373 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  31.3 
 
 		 414 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  34.74 
 
 		 378 aa  177  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  30 
 
 		 395 aa  177  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  31.07 
 
 		 386 aa  177  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2049  aminotransferase class V  34.42 
 
 		 402 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 404 aa  177  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  32.54 
 
 		 407 aa  177  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  30.38 
 
 		 382 aa  177  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>