More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4203 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4203  aminotransferase, class V  100 
 
 		 382 aa  779    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  53.8 
 
 		 380 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  51.91 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  50.95 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  48.91 
 
 		 372 aa  358  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.67 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  47.21 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  47.21 
 
 		 421 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  47.04 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  48.51 
 
 		 404 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  47.4 
 
 		 403 aa  348  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  46.85 
 
 		 407 aa  348  8e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  48.49 
 
 		 404 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  45.5 
 
 		 436 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  45.5 
 
 		 436 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  47.34 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  46.77 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  46.85 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  46.81 
 
 		 404 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  47.47 
 
 		 403 aa  345  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  46.15 
 
 		 407 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  48.22 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  46.15 
 
 		 407 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  46.15 
 
 		 407 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  45.5 
 
 		 403 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 407 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  45.24 
 
 		 403 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 407 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  46.28 
 
 		 405 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  47.95 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  45.92 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  46.81 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  45.92 
 
 		 405 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 407 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  45.72 
 
 		 406 aa  342  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.21 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  45.87 
 
 		 410 aa  340  2e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  46.01 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  45.45 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  45.48 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  45.45 
 
 		 406 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  45.67 
 
 		 387 aa  339  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  44.59 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 406 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  338  7e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  44.86 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  47.61 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  46.28 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  47.61 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  45.55 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  44.92 
 
 		 407 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.21 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  47.07 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  44.85 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  46.83 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  44.95 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  45.74 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  46.45 
 
 		 404 aa  336  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  43.32 
 
 		 430 aa  335  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  45.33 
 
 		 406 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  47.34 
 
 		 404 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  46.54 
 
 		 404 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  44.59 
 
 		 395 aa  335  7.999999999999999e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  46.61 
 
 		 414 aa  335  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  47.34 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  44.68 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  46.01 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  45.97 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  46.01 
 
 		 404 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  44.27 
 
 		 415 aa  333  2e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0006  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  45.21 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  44.32 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  47.51 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  46.01 
 
 		 399 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  46.42 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  43.98 
 
 		 406 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  44.41 
 
 		 407 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.21 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>