More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3416 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  100 
 
 		 399 aa  810    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  70.76 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  70.31 
 
 		 388 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  69.17 
 
 		 389 aa  569  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  67.97 
 
 		 389 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  70.31 
 
 		 388 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  69.19 
 
 		 389 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  60.69 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  57.88 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  58.49 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  58.49 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  58.64 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  58.12 
 
 		 403 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  59.33 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  56.46 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  58.64 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  58.63 
 
 		 388 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  56.73 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  55.15 
 
 		 407 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  56.08 
 
 		 405 aa  441  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  56.46 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  55.41 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  54.88 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  54.88 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  54.88 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  55.03 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  55.29 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  54.62 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  54.88 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  54.62 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  54.88 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  54.62 
 
 		 407 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  55.03 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  54.88 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  55.03 
 
 		 407 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  56.43 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  54.23 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  54.35 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  54.5 
 
 		 407 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  54.35 
 
 		 407 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  54.35 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  56.45 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  54.23 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  54.59 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  55.91 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  53.87 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  56.58 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  56.58 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  57.14 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  55.26 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  55.79 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  55.38 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  55.53 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  56.17 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  55.38 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  55.38 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  55.64 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  55.79 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  56.96 
 
 		 404 aa  424  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  55.38 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  55.12 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  55.79 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  56.28 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  55.64 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  55.53 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  55.38 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  54.33 
 
 		 404 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  55.15 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  54.35 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  53.81 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  55.15 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  55.12 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  54.88 
 
 		 403 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  55.64 
 
 		 407 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  54.47 
 
 		 414 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  55 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  54.76 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  55.79 
 
 		 404 aa  418  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  54.33 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  54.09 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  54.09 
 
 		 405 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  53.7 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  55 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  56.32 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  56.99 
 
 		 403 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  55.53 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  55.77 
 
 		 406 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  53.03 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  53.49 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  53.54 
 
 		 404 aa  415  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  55.53 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  55.53 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>