More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5192 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  100 
 
 		 392 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  63.52 
 
 		 403 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  60.73 
 
 		 405 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  57.85 
 
 		 417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  53.97 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  53.7 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  53.97 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  53.44 
 
 		 403 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  54.31 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 405 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  53.52 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  53.83 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  53.3 
 
 		 419 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  53.52 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  54.23 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  54.11 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  53.52 
 
 		 404 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  52.76 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  53.79 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  53.56 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  53.85 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  54.23 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  51.97 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  53.32 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  51.05 
 
 		 399 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  53.89 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  52.65 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  53.32 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  53.58 
 
 		 407 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  52.48 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  51.18 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  52.74 
 
 		 404 aa  391  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  53.52 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  53.3 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  51.33 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  52.24 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  52.48 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  53.32 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.63 
 
 		 388 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  52.48 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  54.23 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  53.32 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  53.32 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  52.79 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  53.13 
 
 		 389 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  53.32 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  54.07 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  52.48 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  52.24 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  52.24 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  52.24 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  54.57 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  52.36 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  54.83 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  54.57 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  54.57 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  51.72 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  53 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  51.45 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  53.52 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  52.52 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  52.24 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  53.03 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  53.4 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  50.79 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  52.73 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  52.47 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  51.7 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  51.17 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>