More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3007 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3007  aminotransferase, class V  100 
 
 		 378 aa  769    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  46.26 
 
 		 380 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4203  aminotransferase, class V  47.01 
 
 		 382 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4680  Cysteine desulfurase  45.89 
 
 		 372 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46473  normal  0.290444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  42.7 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  43.09 
 
 		 392 aa  308  6.999999999999999e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 382 aa  308  8e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  42.67 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.74 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  42.55 
 
 		 507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  42.55 
 
 		 389 aa  305  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.9 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.62 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  43.5 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  44.2 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  42.37 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  43.24 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  43.88 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.55 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  42.51 
 
 		 403 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  42.97 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.47 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  42.36 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.33 
 
 		 400 aa  299  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 404 aa  298  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  42.09 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  41.91 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  42.09 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  41.64 
 
 		 493 aa  297  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.09 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.09 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  43.92 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  41.4 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  41.82 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  42.7 
 
 		 404 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  41.55 
 
 		 407 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 404 aa  295  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  41.07 
 
 		 389 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  39.42 
 
 		 403 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.08 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.99 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  42.02 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  39.15 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1277  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  39.15 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1228  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.72712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  39.15 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  42.29 
 
 		 404 aa  292  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  41.29 
 
 		 405 aa  292  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  42.67 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 404 aa  291  9e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  42.29 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  43.28 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.29 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.29 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  39.15 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  40.11 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  42.55 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  42.13 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.42 
 
 		 398 aa  289  4e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.94 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.94 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  42.59 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  41.91 
 
 		 404 aa  289  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.9 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  43.48 
 
 		 404 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  41.87 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  40.98 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  40.98 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  42.44 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  41.87 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  41.87 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  41.87 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  41.87 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  41.87 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  42.74 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>