More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0207 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 
388 aa  789    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  57.62 
 
 
394 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  56.04 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  55.87 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  57.4 
 
 
398 aa  457  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  55.93 
 
 
392 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  57.33 
 
 
398 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  57.33 
 
 
398 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  55.24 
 
 
392 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  58.42 
 
 
409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  53.81 
 
 
394 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  54.88 
 
 
384 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  54.74 
 
 
384 aa  441  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  54.95 
 
 
398 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  54.9 
 
 
398 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  55.41 
 
 
399 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  55.35 
 
 
414 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  54.19 
 
 
398 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  54.4 
 
 
393 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  55.06 
 
 
403 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  56.1 
 
 
392 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  53.85 
 
 
396 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.83 
 
 
404 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  54.01 
 
 
394 aa  425  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  58.16 
 
 
395 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  54.43 
 
 
382 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  54.05 
 
 
389 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  51.32 
 
 
393 aa  419  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  51.45 
 
 
382 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  53.23 
 
 
396 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  53.66 
 
 
404 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  52.36 
 
 
388 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.65 
 
 
396 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  51.82 
 
 
383 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  48.96 
 
 
399 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  49.1 
 
 
406 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  51.04 
 
 
383 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  48.84 
 
 
400 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  53.65 
 
 
390 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
406 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  52.2 
 
 
394 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  48.83 
 
 
405 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  50.13 
 
 
381 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  48.31 
 
 
407 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  49.35 
 
 
403 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  48.44 
 
 
384 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  49.09 
 
 
406 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.6 
 
 
379 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  49.09 
 
 
407 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 
403 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.3 
 
 
400 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  49.09 
 
 
407 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  49.22 
 
 
403 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  49.09 
 
 
407 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  49.09 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  48.56 
 
 
407 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  50.13 
 
 
405 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  49.35 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  49.48 
 
 
436 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  49.09 
 
 
407 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  49.09 
 
 
407 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  49.48 
 
 
436 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  50.13 
 
 
405 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  49.35 
 
 
405 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  48.3 
 
 
406 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  49.23 
 
 
502 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  47.68 
 
 
405 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  50.78 
 
 
405 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  49.09 
 
 
405 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  48.3 
 
 
406 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  47.52 
 
 
406 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  48.56 
 
 
407 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
396 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  47.78 
 
 
430 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  47.78 
 
 
405 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  48.56 
 
 
407 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  48.56 
 
 
411 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  47.56 
 
 
400 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  48.56 
 
 
406 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  47.92 
 
 
386 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
401 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  46.48 
 
 
402 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  48.15 
 
 
395 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  48.04 
 
 
406 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  51.09 
 
 
1143 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  49.09 
 
 
400 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  48.56 
 
 
406 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  48.84 
 
 
403 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  49.74 
 
 
405 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.81 
 
 
404 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  47.93 
 
 
401 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  51.6 
 
 
383 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>