More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1371 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  84.42 
 
 		 390 aa  660    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  100 
 
 		 387 aa  798    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  52.86 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  52.09 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  52.45 
 
 		 403 aa  401  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  53.13 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.31 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  52.86 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  53.54 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  47.67 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  48.57 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  53.57 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  50.39 
 
 		 399 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  48.67 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  48.77 
 
 		 389 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  49.35 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  50.26 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  51.05 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  49.34 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  48.32 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  49.08 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  51.05 
 
 		 384 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.18 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.34 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  48.19 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  48.19 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 407 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  48.94 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.83 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  47.8 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  49.47 
 
 		 404 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  49.35 
 
 		 407 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.31 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  49.48 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  49.1 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.31 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  49.48 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  49.1 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 406 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  48.57 
 
 		 405 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.05 
 
 		 403 aa  361  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  48.7 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  49.22 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  49.22 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  47.93 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  48.7 
 
 		 404 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  51.91 
 
 		 389 aa  359  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  48.72 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  49.22 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  48.49 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  48.7 
 
 		 404 aa  359  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  49.22 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  47.77 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  48.7 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  47.93 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  47.41 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  47.93 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  46.51 
 
 		 408 aa  356  5e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  47.41 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  47.41 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  47.93 
 
 		 404 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.7 
 
 		 414 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  47.67 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>