More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0764 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  100 
 
 		 414 aa  858    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  66.41 
 
 		 402 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  63.45 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  63.64 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  59.14 
 
 		 398 aa  482  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  60.68 
 
 		 399 aa  481  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  60.68 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  60.98 
 
 		 392 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  59.17 
 
 		 392 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  60.16 
 
 		 384 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  57.93 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  60.71 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  61.88 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  59.18 
 
 		 396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  58.85 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  56.77 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  57.96 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  57.25 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  57.25 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  56.96 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  58.14 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  58.81 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  55.76 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  57.4 
 
 		 394 aa  431  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  55.35 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  55.35 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  54.03 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  55.12 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.65 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  52.39 
 
 		 409 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  51.13 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  52.58 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.99 
 
 		 379 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  50.78 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.32 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  49.26 
 
 		 404 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.26 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  52.62 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  52.27 
 
 		 383 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.21 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.26 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  48.19 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  47.19 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  49.1 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  49.22 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.61 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  47.09 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.14 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  46.04 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  48.56 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  47.37 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  46.55 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  48.96 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.29 
 
 		 402 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  50.52 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  46.63 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  46.63 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  45.95 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  49.22 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  49.35 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  46.45 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  48.18 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  48.72 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  49.34 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  48.45 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  47.68 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  47.68 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 404 aa  362  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  48.71 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  47.14 
 
 		 386 aa  361  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 380 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  48.71 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  47.42 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  48.45 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  48.72 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 381 aa  359  5e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  48.28 
 
 		 380 aa  358  7e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  48.06 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  47.94 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  47.89 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.27 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  47.94 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  47.94 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  48.58 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  47.93 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>