More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0173 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  100 
 
 
382 aa  771    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  59.21 
 
 
382 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  60 
 
 
404 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  57.37 
 
 
384 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  56.17 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  57.63 
 
 
384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  55.76 
 
 
392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  58.64 
 
 
394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  56.28 
 
 
398 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  55.09 
 
 
400 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  59.06 
 
 
402 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  56.02 
 
 
394 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  54.19 
 
 
398 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  53.16 
 
 
399 aa  428  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  55.91 
 
 
398 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  54.86 
 
 
393 aa  427  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  56.69 
 
 
393 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  55.12 
 
 
414 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  51.44 
 
 
398 aa  418  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  53.66 
 
 
396 aa  418  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  53.12 
 
 
398 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  53.12 
 
 
398 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  51.45 
 
 
388 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  55.21 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.34 
 
 
396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  56.08 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  56.77 
 
 
392 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  52.37 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
388 aa  395  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  51.17 
 
 
417 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50 
 
 
379 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  47.95 
 
 
409 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  47.64 
 
 
403 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  49.47 
 
 
400 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  51.57 
 
 
386 aa  381  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  46.67 
 
 
395 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  49.35 
 
 
403 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  50.13 
 
 
380 aa  378  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.62 
 
 
394 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  48.44 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  48.95 
 
 
383 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.6 
 
 
400 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  48.44 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  46.88 
 
 
403 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  46.61 
 
 
436 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  46.61 
 
 
436 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  48.45 
 
 
507 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  47.66 
 
 
407 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  48.7 
 
 
404 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  46.61 
 
 
403 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  47.77 
 
 
389 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  48.17 
 
 
383 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.31 
 
 
405 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  47.66 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  47.66 
 
 
403 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  50.53 
 
 
401 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  48.15 
 
 
401 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  48.15 
 
 
401 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  46.88 
 
 
405 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  46.09 
 
 
405 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  48.45 
 
 
404 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  45.6 
 
 
407 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  45.6 
 
 
421 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  47.09 
 
 
404 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  47.63 
 
 
384 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  45.57 
 
 
430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  47.66 
 
 
422 aa  362  6e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  48.19 
 
 
404 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  48.7 
 
 
404 aa  361  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  48.19 
 
 
404 aa  361  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  48.19 
 
 
404 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  48.19 
 
 
404 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  48.19 
 
 
404 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  45.05 
 
 
405 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  48.19 
 
 
404 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  46.95 
 
 
381 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  49.21 
 
 
402 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  46.34 
 
 
391 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  46.32 
 
 
389 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  50.8 
 
 
383 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  46.88 
 
 
405 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  46.61 
 
 
405 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.56 
 
 
396 aa  359  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  46.88 
 
 
405 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  46.09 
 
 
405 aa  358  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  46.29 
 
 
502 aa  358  7e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>