More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3581 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 400 aa  820    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  63.24 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  63.33 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  60.98 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  58.18 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  58.18 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  61.89 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  60.36 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  58.96 
 
 		 384 aa  471  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  57.77 
 
 		 392 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  59.48 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  56.04 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  57.93 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  56.2 
 
 		 398 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  54.92 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  59.85 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  58.38 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  57.4 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  57.33 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  56.2 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  55.99 
 
 		 404 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  56.59 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  54.96 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  56.88 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  55.09 
 
 		 382 aa  435  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  55.08 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  54.95 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  52.79 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.94 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.35 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  55.93 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  51.93 
 
 		 389 aa  408  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  53.28 
 
 		 380 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  52.21 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  51.84 
 
 		 381 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 384 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.17 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  51.93 
 
 		 403 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  50.9 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  50.39 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  50.63 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.19 
 
 		 379 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  51.79 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  51.16 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  51.41 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  51.41 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  51.54 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  49.12 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  51.54 
 
 		 404 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  50.64 
 
 		 405 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  50 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  50 
 
 		 407 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  50.78 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  48.58 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  49.48 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  51.02 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  51.95 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  48.72 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  50.13 
 
 		 507 aa  381  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  48.59 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.54 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  50.13 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  48.72 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  50 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  49.49 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  48.84 
 
 		 391 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  50.39 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  49.49 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  49.62 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  46.62 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  49.62 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  49.61 
 
 		 388 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  49.62 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  51.31 
 
 		 401 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  49.35 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>