More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1714 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 394 aa  799    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  71.36 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  68.95 
 
 		 384 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  66.32 
 
 		 392 aa  535  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  68.68 
 
 		 384 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  66.15 
 
 		 393 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  64.05 
 
 		 396 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  63.33 
 
 		 398 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  63.33 
 
 		 398 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  63.75 
 
 		 398 aa  519  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  64.4 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  64.68 
 
 		 404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  63.92 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  61.83 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  60.73 
 
 		 399 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  64.42 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  67.01 
 
 		 392 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  61.56 
 
 		 393 aa  494  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  63.45 
 
 		 414 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  61.62 
 
 		 398 aa  490  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  60.98 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  58.35 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  61.3 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  60.21 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  60.79 
 
 		 382 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  54.22 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  58.64 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  54.9 
 
 		 389 aa  441  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  53.81 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  55.04 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  54.06 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  53.37 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  53.02 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  52.25 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  51.31 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.18 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  50.9 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  51.44 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  49.35 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  50 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.05 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  48.45 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  49.23 
 
 		 405 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 		 384 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  52.14 
 
 		 383 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  50 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  48.69 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.46 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  49.74 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  49.49 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  48 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  51.71 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  48.46 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.46 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  48.7 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  49.73 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.21 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  48.95 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.21 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.21 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  48.44 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  47.19 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  47.7 
 
 		 406 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  48.46 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  49.35 
 
 		 383 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  48.46 
 
 		 407 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  48.45 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  47.44 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  48.46 
 
 		 407 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  48.46 
 
 		 407 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.05 
 
 		 402 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  48.09 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  47.44 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  48.46 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  48.21 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>