More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0720 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  100 
 
 		 394 aa  808    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  71.36 
 
 		 394 aa  594  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  73.78 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  67.35 
 
 		 396 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  65.89 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  68.68 
 
 		 384 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  64.69 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  64.69 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  64.62 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  67.37 
 
 		 384 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  62.94 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  63.24 
 
 		 400 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  65.28 
 
 		 392 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  63.4 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  63.33 
 
 		 404 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  61.76 
 
 		 398 aa  518  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  62.04 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  62.83 
 
 		 392 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  62.14 
 
 		 398 aa  495  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  63.64 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  65.45 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  62.44 
 
 		 390 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  61.24 
 
 		 402 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  57.62 
 
 		 388 aa  477  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  58.42 
 
 		 409 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  60.98 
 
 		 394 aa  471  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  58.06 
 
 		 395 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  57.07 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  55.81 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  59.16 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  56.02 
 
 		 382 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.26 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  54.71 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  54.91 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  52.23 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  51.3 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  52.63 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  52.43 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  51.86 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.84 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  54.13 
 
 		 381 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  49.1 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  50.65 
 
 		 406 aa  398  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  51.56 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  49.62 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  49.62 
 
 		 421 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  52.88 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 407 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  50.91 
 
 		 386 aa  391  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  50.38 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  50.92 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  49.49 
 
 		 407 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.97 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  49.47 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 403 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  52.27 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  48.97 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  49.75 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  48.46 
 
 		 407 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  49.75 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 		 402 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  48.97 
 
 		 405 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  51.58 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  48.97 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  48.46 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  47.41 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  51.46 
 
 		 381 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  50.8 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.46 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  50.13 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  48.76 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  50.64 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.45 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  50.51 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  48.72 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  50.51 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  48.72 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  49.47 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.45 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.47 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  48.21 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.45 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>