More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0188 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  100 
 
 		 382 aa  763    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0546  aminotransferase class V  55.11 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0396718  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  48.4 
 
 		 383 aa  352  8e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  49.33 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  49.07 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  52.88 
 
 		 385 aa  345  6e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  46.28 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.62 
 
 		 382 aa  344  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  48.13 
 
 		 379 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  46.68 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  49.2 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  49.2 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  49.2 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  49.2 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  49.2 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  48.2 
 
 		 404 aa  332  8e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  49.2 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.88 
 
 		 392 aa  328  9e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.24 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  46.15 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 387 aa  326  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  44.71 
 
 		 394 aa  325  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 414 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.71 
 
 		 409 aa  325  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  45.26 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0109  aminotransferase, class V  53.68 
 
 		 385 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  49.18 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  49.46 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.14 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  49.18 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4569  aminotransferase, class V  46.92 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32084  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  49.18 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.77 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  47.06 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  48.27 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  46.01 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  46.37 
 
 		 399 aa  319  6e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  50 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.15 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  43.88 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 398 aa  316  5e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  43.38 
 
 		 389 aa  316  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  44.08 
 
 		 384 aa  315  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.54 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.76 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.74 
 
 		 404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  49.73 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  45.16 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  48.67 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.68 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.46 
 
 		 394 aa  312  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  44.15 
 
 		 389 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.41 
 
 		 383 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  43.88 
 
 		 389 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  45.57 
 
 		 406 aa  311  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 389 aa  311  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  47.96 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.09 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  43.35 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  44.27 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  45.45 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 383 aa  309  5e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  48.08 
 
 		 1143 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  42.48 
 
 		 393 aa  308  8e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.95 
 
 		 396 aa  308  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  43.51 
 
 		 405 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.37 
 
 		 382 aa  308  9e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  43.51 
 
 		 405 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  47.11 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.58 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  45.09 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  44.24 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  44.53 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  43.19 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.24 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  43.68 
 
 		 407 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  43.68 
 
 		 407 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  43.68 
 
 		 407 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  43.68 
 
 		 407 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  46.83 
 
 		 408 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  43.83 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.57 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  43.42 
 
 		 407 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  43.68 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 407 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  48.78 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 407 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 407 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.67 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  42.97 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  41.58 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  45.29 
 
 		 399 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>