More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2431 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  100 
 
 		 390 aa  788    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  71.28 
 
 		 399 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  66.32 
 
 		 396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  61.54 
 
 		 398 aa  508  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  62.3 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  62.89 
 
 		 396 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  61.42 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  62.44 
 
 		 394 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  61.58 
 
 		 384 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  62.72 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  60.84 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  60.21 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  62.27 
 
 		 392 aa  481  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  61.88 
 
 		 414 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  57.59 
 
 		 392 aa  474  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  61.1 
 
 		 382 aa  471  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  58.22 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  62.6 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  56.02 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  58.12 
 
 		 393 aa  454  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  57.81 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  57.81 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  57.96 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  57.25 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  56.88 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  55.93 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  55.47 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  54.45 
 
 		 389 aa  418  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  52.37 
 
 		 382 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  53.96 
 
 		 409 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  52.48 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  53.65 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  53.87 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  53.4 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.57 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  52.74 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  51.58 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  50.4 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  49.35 
 
 		 386 aa  378  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  50.53 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.65 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  52.99 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  50.66 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  44.36 
 
 		 388 aa  371  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  51.18 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  47.15 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  46.65 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  50 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  52.07 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.78 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  49.22 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  49.22 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  47.92 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  50.65 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  48.85 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  48.7 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  48.87 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  49.35 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  48.82 
 
 		 381 aa  363  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.8 
 
 		 386 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  48.53 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  48.17 
 
 		 389 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  48.35 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  48.69 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  46.63 
 
 		 402 aa  360  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 		 389 aa  359  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  49.07 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  49.35 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 407 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  49.87 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  48.7 
 
 		 401 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  47.24 
 
 		 381 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  49.61 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  46.98 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  49.35 
 
 		 436 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 407 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  48.97 
 
 		 404 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  49.35 
 
 		 436 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  46.98 
 
 		 381 aa  352  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  46.98 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  48.06 
 
 		 387 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  46.46 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  49.1 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  48.7 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>