More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1344 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  100 
 
 		 406 aa  835    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  65.06 
 
 		 403 aa  554  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  53.93 
 
 		 384 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  50.9 
 
 		 392 aa  418  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  53.28 
 
 		 384 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  50.91 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  50.65 
 
 		 394 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  49.49 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 382 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 392 aa  391  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  49.1 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  48.58 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  48.45 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.19 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  50.38 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  48.59 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  48.45 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  47.59 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  48.45 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  47.61 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  47.61 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  47.49 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  47.96 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.49 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.81 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.25 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  47.15 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.96 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  44.91 
 
 		 382 aa  346  4e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  45.82 
 
 		 405 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  46.37 
 
 		 389 aa  338  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 409 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  46.75 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.37 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  45.08 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  46.75 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.8 
 
 		 379 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.85 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 383 aa  329  6e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  42.6 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  44.05 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  43.69 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  41.86 
 
 		 389 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  41.92 
 
 		 406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.77 
 
 		 396 aa  325  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  42.68 
 
 		 404 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  42.13 
 
 		 405 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  44.16 
 
 		 400 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  42.64 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  42.64 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  44.3 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  43.18 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  42.89 
 
 		 406 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 407 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  41.97 
 
 		 407 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  42.46 
 
 		 403 aa  322  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 407 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.26 
 
 		 417 aa  323  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 407 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 407 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  43.18 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  41.09 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 407 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  41.97 
 
 		 407 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  41.97 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 407 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.23 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  41.45 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  44.94 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.45 
 
 		 407 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.45 
 
 		 407 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.45 
 
 		 407 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.7 
 
 		 386 aa  319  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  42.79 
 
 		 408 aa  318  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  41.34 
 
 		 389 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  42.6 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  40.57 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  42.35 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  43.69 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  41.45 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.54 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  43.41 
 
 		 389 aa  317  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  45.48 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  42.46 
 
 		 404 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  42.96 
 
 		 404 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  43.56 
 
 		 404 aa  315  8e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  41.09 
 
 		 389 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  42.46 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.92 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>