More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1343 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  100 
 
 		 389 aa  788    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  55.81 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  57.29 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  54.9 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  55.41 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  55.84 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  55.81 
 
 		 398 aa  431  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  54.86 
 
 		 384 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  54.05 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  55.41 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  54.07 
 
 		 384 aa  424  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  54.12 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  51.79 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  51.79 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  52.47 
 
 		 398 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  53.25 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  52.84 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  55.5 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  53.52 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  52.11 
 
 		 392 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  57.18 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  52.73 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  52.47 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  51.93 
 
 		 400 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  52.58 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  52.63 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  54.45 
 
 		 390 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  52.88 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  52.2 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  50.52 
 
 		 403 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  48.03 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.38 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  48.82 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  49.47 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  49.21 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  48.04 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  47.77 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.11 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  47.49 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  49.21 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  47.8 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  44.53 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  47.29 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  46.28 
 
 		 379 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  44.65 
 
 		 388 aa  358  9e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  47.79 
 
 		 407 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  47.53 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  47.53 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  45 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  47.01 
 
 		 407 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  47.01 
 
 		 407 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  47.79 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  47.79 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  47.79 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  47.79 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  47.27 
 
 		 407 aa  355  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  46.75 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 391 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  47.53 
 
 		 407 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  46.75 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  46.75 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  46.75 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  47.41 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  47.73 
 
 		 381 aa  352  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  47.23 
 
 		 401 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  46.75 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  46.75 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  47.23 
 
 		 401 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.01 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  44.33 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  45.97 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  46.7 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  46.79 
 
 		 408 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  46.23 
 
 		 405 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  46.23 
 
 		 405 aa  349  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  45.91 
 
 		 400 aa  348  7e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  46.89 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.53 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  46.23 
 
 		 406 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  46.54 
 
 		 379 aa  346  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 386 aa  345  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  45.14 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  44.16 
 
 		 388 aa  345  1e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  48 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  44.01 
 
 		 402 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  46.67 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  46.4 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  46.15 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  45.1 
 
 		 403 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 381 aa  342  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 381 aa  342  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  45.71 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  45.48 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  46.25 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  46.13 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>