More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2808 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  100 
 
 		 379 aa  768    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  62.37 
 
 		 380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  52.6 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  55.98 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  55.98 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  55.98 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  56.25 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  55.65 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  55.98 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  53.91 
 
 		 385 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  50 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.81 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  49.2 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.85 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  46.52 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.2 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.27 
 
 		 382 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  49.32 
 
 		 399 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  46.24 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.81 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  47.71 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  47.61 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  49.19 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  47.34 
 
 		 402 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  49.33 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.04 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.98 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.59 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  46.54 
 
 		 389 aa  346  5e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16873  predicted protein  49.87 
 
 		 405 aa  345  7e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0124247  normal  0.537362 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  46.01 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  47.64 
 
 		 409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  45.99 
 
 		 404 aa  339  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  45.99 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  48.79 
 
 		 383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.51 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.4 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.12 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  48.79 
 
 		 380 aa  332  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.56 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  46.4 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.26 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  47.96 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  45.93 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  44.65 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.19 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.72 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 398 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 398 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  45.07 
 
 		 421 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  45.07 
 
 		 407 aa  325  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  46.97 
 
 		 398 aa  323  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.51 
 
 		 388 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  44.12 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  45.77 
 
 		 388 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  47.77 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.68 
 
 		 392 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  49.47 
 
 		 387 aa  322  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  45.14 
 
 		 389 aa  319  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 388 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  44.09 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  45.36 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.04 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  45.6 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  43.62 
 
 		 393 aa  315  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  44.95 
 
 		 404 aa  315  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  315  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  45.01 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  45.07 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1228  cysteine desulfurase  45.07 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.72712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  45.07 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1277  cysteine desulfurase  45.07 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.62 
 
 		 400 aa  312  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  43.55 
 
 		 399 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  45.21 
 
 		 404 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  44.8 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  45.07 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  43.97 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  46.87 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  44.27 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  47.3 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  43.73 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  43.97 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  43.05 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>