More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1837 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 396 aa  811    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  70.85 
 
 		 398 aa  589  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  69.6 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  67.35 
 
 		 394 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  67.37 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  66.49 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  66.32 
 
 		 384 aa  537  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  65.36 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  65.04 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  64.05 
 
 		 394 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  64.78 
 
 		 404 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  64.62 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  64.62 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  60.82 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  66.32 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  62.44 
 
 		 392 aa  494  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  63.19 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  59.59 
 
 		 402 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  60.62 
 
 		 398 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  58.01 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  60.71 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  59.85 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  58.49 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  63.02 
 
 		 392 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  56.27 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  55.5 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  56.7 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  53.85 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  55.5 
 
 		 395 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  56.12 
 
 		 379 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  53.61 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  55.5 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  53.66 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  53.14 
 
 		 383 aa  410  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  53.4 
 
 		 404 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  52.76 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  52.09 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  51.83 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  51.05 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  51.06 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  51.02 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  49.49 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  52.08 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.26 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  50 
 
 		 391 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.52 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  49.48 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  49.1 
 
 		 402 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  52.27 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  49.1 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  50 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  47.49 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.46 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  51.81 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  51.73 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  49.61 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  49.62 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  52 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  51.47 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  50.39 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  46.49 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  48.96 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  48.96 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  51.2 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  51.2 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.68 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  49.09 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  48.19 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  51.73 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  50.93 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  50.93 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  48.44 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  50.93 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  50.93 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  48.44 
 
 		 389 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  47.64 
 
 		 402 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  47.59 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  47.51 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  48.44 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  47.59 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  50 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  48.22 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  48.6 
 
 		 406 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  48.58 
 
 		 398 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.26 
 
 		 388 aa  362  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.96 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  48.6 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  49.19 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  50.39 
 
 		 404 aa  362  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.22 
 
 		 407 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.22 
 
 		 407 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.22 
 
 		 407 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>