More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1860 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  100 
 
 		 396 aa  820    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  60.11 
 
 		 379 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  58.49 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  57.59 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  56.17 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  55.73 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  55.13 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  55.56 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  55.91 
 
 		 384 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  55.61 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  55.18 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  55.26 
 
 		 399 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  54.52 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  54.31 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  53.89 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  56.05 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  52.47 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  53.4 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  53.73 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  56.88 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  50.64 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  53.35 
 
 		 400 aa  421  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  54.83 
 
 		 398 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  53.26 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  54.45 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  53.65 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  56.48 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  53.26 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  53.28 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  53.26 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  53.28 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  52.22 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  51.55 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  50.77 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  56.33 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  50.91 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  53.52 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  52.28 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  52.76 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  51.3 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  51.04 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  51.93 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  49.34 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  55.03 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  52.6 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  50.78 
 
 		 389 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  51.7 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.38 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  50.52 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 391 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  49.23 
 
 		 391 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  50.91 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  48.96 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  50.76 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  51.15 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  51.16 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  51.55 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  49.24 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  48.96 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  52.93 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  49.08 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  47.8 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  47.38 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  49.09 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  47.48 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  52.06 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  50.39 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.96 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  50.81 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  48.03 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  48.05 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  46.49 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  51.03 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  48.44 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  50.52 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  48.27 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  48.59 
 
 		 397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  48.18 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  49.34 
 
 		 388 aa  358  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  48.94 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  49.22 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  47.12 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  47.53 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  47.91 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 388 aa  352  7e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  46.58 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  47.88 
 
 		 381 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  46.23 
 
 		 410 aa  349  4e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  46.17 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  47.66 
 
 		 403 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  47.92 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  47.92 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>