More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0872 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  100 
 
 		 380 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  71.54 
 
 		 394 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  71.28 
 
 		 379 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  55.03 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  51.06 
 
 		 392 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  51.2 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  51.86 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  51.19 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  52.39 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  52.89 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  52.91 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  50.79 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  50.79 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  49.6 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  50.26 
 
 		 398 aa  371  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  49.07 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  49.47 
 
 		 402 aa  371  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.92 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50.67 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  46.44 
 
 		 382 aa  371  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  50.66 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.94 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  51.06 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  48.55 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  53.17 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  51.47 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.2 
 
 		 404 aa  362  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 382 aa  362  6e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  51.2 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 389 aa  361  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.41 
 
 		 402 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  50 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.45 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.84 
 
 		 409 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  48.41 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  47.62 
 
 		 404 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.2 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  49.33 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  50.39 
 
 		 392 aa  351  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  48.79 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  49.34 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  47.07 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  48.41 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  48.15 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  45.65 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.15 
 
 		 388 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.34 
 
 		 386 aa  346  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  45.78 
 
 		 373 aa  345  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  48.54 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.21 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  47.09 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  48.4 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  48.41 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.84 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  44.71 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  46.15 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  48.52 
 
 		 414 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.02 
 
 		 405 aa  339  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  48.52 
 
 		 373 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  48.52 
 
 		 373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  48.52 
 
 		 373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  48.52 
 
 		 373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  48.52 
 
 		 373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  46.44 
 
 		 389 aa  338  8e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  47.09 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  48.16 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  48.56 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  47.73 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  47.62 
 
 		 1135 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  48.82 
 
 		 383 aa  336  5e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  47.51 
 
 		 400 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  48.4 
 
 		 385 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  47.61 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.3 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  46.68 
 
 		 383 aa  332  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  47.95 
 
 		 1143 aa  332  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  47.47 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  45.09 
 
 		 386 aa  329  4e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  49.08 
 
 		 407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  44.27 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  47.49 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.65 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  46.44 
 
 		 389 aa  327  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  46.44 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  44.27 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  47.49 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  47.12 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  44.74 
 
 		 403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  44.27 
 
 		 381 aa  325  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  46.83 
 
 		 421 aa  325  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  46.83 
 
 		 407 aa  325  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>