More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1225 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  100 
 
 		 402 aa  816    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 397 aa  815    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  70.28 
 
 		 402 aa  598  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  67.34 
 
 		 404 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  64.48 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  67 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  64.12 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  62.63 
 
 		 400 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  63.42 
 
 		 393 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  63.59 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  62.8 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  63.06 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.74 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  63.85 
 
 		 389 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  63.85 
 
 		 388 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  62.03 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  62.27 
 
 		 402 aa  488  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  63.59 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  62.99 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  61.46 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  59.45 
 
 		 402 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  60.69 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  62.47 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.53 
 
 		 398 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  63.06 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  63.06 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  60.95 
 
 		 388 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  59.58 
 
 		 391 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  60.95 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  61.21 
 
 		 387 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  57.89 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  60.16 
 
 		 387 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  58.42 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  59.24 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  59.44 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  58.05 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  58.14 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  57.92 
 
 		 410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  56.85 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  56.6 
 
 		 404 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  46.63 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.91 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.83 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  47.78 
 
 		 400 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  47.51 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.35 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.46 
 
 		 394 aa  362  8e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  47.27 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.95 
 
 		 392 aa  359  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.76 
 
 		 399 aa  358  9e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  47.51 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  46.72 
 
 		 398 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  46.46 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.67 
 
 		 388 aa  348  8e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  47.23 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  45.14 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.17 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.17 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.79 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.95 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  43.57 
 
 		 382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  46.97 
 
 		 393 aa  342  8e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  45.76 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  45.95 
 
 		 393 aa  339  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.43 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.33 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.62 
 
 		 382 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  48.12 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 394 aa  332  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  45.48 
 
 		 401 aa  330  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.19 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  44.94 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.19 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.07 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  44.07 
 
 		 401 aa  326  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  43.65 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  43.88 
 
 		 398 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  46.28 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  44.25 
 
 		 398 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  43.11 
 
 		 401 aa  322  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  46.35 
 
 		 407 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  44.44 
 
 		 394 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.44 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  44.09 
 
 		 403 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  42.78 
 
 		 404 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  43.42 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 407 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  45.08 
 
 		 507 aa  318  9e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>