More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1939 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  100 
 
 		 388 aa  785    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  63.82 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  60.51 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  60.51 
 
 		 395 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  55.04 
 
 		 394 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  55 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  55.26 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  54.71 
 
 		 394 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  54.43 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  54.05 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  53.12 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  51.83 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  51.58 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  52.2 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  52.36 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  52.23 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  52.6 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  51.3 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  51.83 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  50.78 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  52.23 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  50.52 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  49.48 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  50.79 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  50 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.59 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  49.21 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  50.52 
 
 		 383 aa  364  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  50.65 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  50.66 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.34 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.57 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  45.93 
 
 		 382 aa  353  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  49.18 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  49.09 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  47.53 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  48.31 
 
 		 400 aa  345  8.999999999999999e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.86 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  48.69 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  46.86 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.38 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  48.43 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  48.81 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  46.72 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  47.24 
 
 		 391 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  47.53 
 
 		 381 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.85 
 
 		 402 aa  338  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  47.67 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  48.19 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  46.88 
 
 		 391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  46.37 
 
 		 407 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  45.69 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 407 aa  335  7e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 		 400 aa  335  9e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  47.51 
 
 		 389 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 404 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  45.43 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  48.56 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  47.24 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  48.56 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  46.43 
 
 		 381 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  47.15 
 
 		 404 aa  332  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  49.34 
 
 		 401 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  47.12 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  47.12 
 
 		 381 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  47.12 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.71 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.6 
 
 		 398 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  46.34 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  46.07 
 
 		 402 aa  328  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  44.13 
 
 		 400 aa  328  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  46.85 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  46.85 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  46.63 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  45.14 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  46.77 
 
 		 404 aa  326  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  45.88 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  48.19 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  46.67 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>