More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2659 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 404 aa  825    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  81.2 
 
 		 394 aa  641    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  77.44 
 
 		 396 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  67.76 
 
 		 400 aa  569  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  66.49 
 
 		 407 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  65.22 
 
 		 393 aa  542  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  65.27 
 
 		 384 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  66.49 
 
 		 389 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  66.49 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  65.97 
 
 		 391 aa  529  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  65.62 
 
 		 391 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  65.89 
 
 		 391 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  63.35 
 
 		 402 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  63.45 
 
 		 400 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  64.3 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  64.66 
 
 		 400 aa  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  64.92 
 
 		 389 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.36 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  63.97 
 
 		 401 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  63.97 
 
 		 401 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  64.14 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  63.61 
 
 		 398 aa  502  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  60.72 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  62.5 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  63.97 
 
 		 401 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  62.8 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  62.47 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  61.36 
 
 		 400 aa  481  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  58.49 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  57.68 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  60.61 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  55.09 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  55.12 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  54.31 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  59.53 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  54.48 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  56.62 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  57.18 
 
 		 379 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  53.66 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  52.6 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  56.01 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  52.63 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  53.63 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  51.16 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  53.89 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  52.21 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  55.32 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  53.89 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  50.66 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  50.92 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  52.37 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  51.05 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  49.26 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  52.48 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  52.48 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  53.4 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  51.97 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  52.48 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  49 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  54.59 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  52.44 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.98 
 
 		 395 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  53.4 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  51.97 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  51.3 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  51.17 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.18 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  49.74 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  48.25 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  53.24 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  47.09 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  50.92 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  50.91 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  50.91 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  50.65 
 
 		 388 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  48.64 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  50.39 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  49.87 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  49.61 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  48.29 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  49.61 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 405 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  49.48 
 
 		 386 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  49.48 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  49.35 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  49.61 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  48.7 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  49.35 
 
 		 407 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  47.73 
 
 		 401 aa  355  5e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  49.09 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>