More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3884 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  100 
 
 
398 aa  805    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  65.81 
 
 
409 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  62.14 
 
 
394 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  64.47 
 
 
395 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  60.41 
 
 
398 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  61.98 
 
 
384 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  61.62 
 
 
384 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  63.82 
 
 
388 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  58.35 
 
 
398 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  58.35 
 
 
394 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  60.16 
 
 
398 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  59.27 
 
 
399 aa  462  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  60.62 
 
 
396 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  57.29 
 
 
392 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  56.77 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  57.4 
 
 
400 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  57.4 
 
 
388 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  58.51 
 
 
393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  57.51 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  57.55 
 
 
392 aa  451  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  60.57 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  55.3 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  55.3 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  55.04 
 
 
393 aa  443  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  56.4 
 
 
403 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  57.96 
 
 
390 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  56.66 
 
 
402 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  55.81 
 
 
389 aa  431  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  55.35 
 
 
414 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  55.7 
 
 
394 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  53.93 
 
 
382 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  51.44 
 
 
382 aa  418  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.52 
 
 
396 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  54.29 
 
 
383 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  53.25 
 
 
383 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  52.77 
 
 
381 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  52.2 
 
 
417 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  52.48 
 
 
404 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  53.12 
 
 
394 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  53.65 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  51.95 
 
 
396 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  53.32 
 
 
379 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.31 
 
 
400 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  51.19 
 
 
394 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  53.49 
 
 
399 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  50 
 
 
400 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  51.45 
 
 
381 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  51.98 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.84 
 
 
402 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  52.24 
 
 
381 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  52.24 
 
 
381 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  52.24 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 
399 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  52.24 
 
 
381 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  50.77 
 
 
404 aa  374  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 
400 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 
403 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  49.47 
 
 
395 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  51.98 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  51.98 
 
 
381 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.81 
 
 
388 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  51.98 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  51.15 
 
 
388 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  49.48 
 
 
507 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  48.84 
 
 
405 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 
389 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.47 
 
 
403 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  52.33 
 
 
408 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  47.81 
 
 
406 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  48.58 
 
 
386 aa  367  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  50.92 
 
 
381 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.47 
 
 
436 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  50.92 
 
 
381 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.47 
 
 
436 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.36 
 
 
389 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  48.83 
 
 
384 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  48.47 
 
 
391 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  50.63 
 
 
401 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.21 
 
 
403 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.56 
 
 
391 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 
401 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  47.44 
 
 
389 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 
401 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  47.57 
 
 
391 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  45.85 
 
 
388 aa  361  1e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.74 
 
 
398 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.03 
 
 
386 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  48.19 
 
 
389 aa  359  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  53.76 
 
 
1135 aa  359  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  47.81 
 
 
405 aa  359  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  46.63 
 
 
393 aa  358  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  50.39 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  48.72 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  46.79 
 
 
405 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  49.62 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  47.55 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.21 
 
 
405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  47.18 
 
 
403 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  51.49 
 
 
388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>