More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08880 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  100 
 
 
392 aa  798    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  67.01 
 
 
394 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  65.45 
 
 
394 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  62.85 
 
 
392 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  61.89 
 
 
400 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  63.47 
 
 
384 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  62.02 
 
 
392 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  63.21 
 
 
384 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  62.79 
 
 
398 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  62.86 
 
 
404 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  61.3 
 
 
398 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  61.3 
 
 
398 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  63.02 
 
 
396 aa  471  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  61.07 
 
 
402 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  60.57 
 
 
398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  60.78 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  62.6 
 
 
390 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  60.94 
 
 
394 aa  465  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  60.1 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  58.87 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  58.55 
 
 
398 aa  455  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  58.81 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  60.1 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  56.1 
 
 
388 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  58.18 
 
 
393 aa  443  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  58.03 
 
 
382 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  56.33 
 
 
396 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  57.18 
 
 
389 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  55.1 
 
 
409 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  55.41 
 
 
403 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  56.77 
 
 
382 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  55.06 
 
 
396 aa  411  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  54.05 
 
 
388 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  54.85 
 
 
395 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  54.59 
 
 
404 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  54.12 
 
 
384 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  53.75 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  54.23 
 
 
379 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  52.76 
 
 
381 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  50.13 
 
 
406 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  52.32 
 
 
386 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  52.33 
 
 
400 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 
400 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  52.23 
 
 
380 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  50.52 
 
 
399 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  51.95 
 
 
400 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  49.61 
 
 
400 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  53.11 
 
 
386 aa  383  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  52.2 
 
 
407 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  48.84 
 
 
402 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  51.44 
 
 
402 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  52.44 
 
 
403 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  51.79 
 
 
401 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  51.71 
 
 
381 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  53.11 
 
 
394 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  51.71 
 
 
381 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  51.79 
 
 
401 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  53.79 
 
 
401 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  51.4 
 
 
417 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  50.92 
 
 
381 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  51.02 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  50.92 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  51.02 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  51.02 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.84 
 
 
404 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  49.49 
 
 
405 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 
397 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  50.77 
 
 
403 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  51.44 
 
 
381 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  50.77 
 
 
436 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  51.02 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  50.77 
 
 
403 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  51.02 
 
 
407 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  50.77 
 
 
436 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  51.03 
 
 
391 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  50.66 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  50.66 
 
 
381 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  50.77 
 
 
407 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  48.06 
 
 
403 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.51 
 
 
398 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  50.77 
 
 
407 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  51.18 
 
 
381 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  50.66 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  50.39 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  51.29 
 
 
407 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  51.81 
 
 
400 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  50.77 
 
 
407 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  51.3 
 
 
383 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.47 
 
 
394 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
410 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  50.13 
 
 
381 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  47.8 
 
 
402 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  50.26 
 
 
405 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  50.77 
 
 
404 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  49.87 
 
 
408 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  48.45 
 
 
391 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  48.56 
 
 
388 aa  368  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>