More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4134 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  100 
 
 
400 aa  828    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  75 
 
 
399 aa  630  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  75.69 
 
 
401 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  75.69 
 
 
401 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  76.26 
 
 
401 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  76.02 
 
 
400 aa  629  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  77.04 
 
 
398 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  72.25 
 
 
402 aa  607  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  66.4 
 
 
389 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  65.21 
 
 
396 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  65.89 
 
 
394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  64.66 
 
 
404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  62.2 
 
 
393 aa  511  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  64.3 
 
 
389 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  64.04 
 
 
389 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  62.92 
 
 
391 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  61.88 
 
 
391 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  61.15 
 
 
391 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  62.2 
 
 
388 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  61.4 
 
 
384 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  62.12 
 
 
402 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  60.62 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.36 
 
 
404 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  62.03 
 
 
397 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  60.79 
 
 
402 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  58.33 
 
 
407 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  58.01 
 
 
386 aa  464  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  58.31 
 
 
400 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  58.12 
 
 
402 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  57.66 
 
 
388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  58.81 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  57.96 
 
 
400 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  60.78 
 
 
404 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.89 
 
 
396 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  55.38 
 
 
397 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  53.63 
 
 
387 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  53.09 
 
 
388 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  52.58 
 
 
387 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  52.38 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  52.24 
 
 
384 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  53.37 
 
 
410 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  53.61 
 
 
407 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  54.93 
 
 
379 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  51.96 
 
 
404 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  52.96 
 
 
407 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  51.3 
 
 
399 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  54.85 
 
 
404 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  51.17 
 
 
398 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  50.39 
 
 
398 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  52.32 
 
 
398 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  52.32 
 
 
398 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  50.9 
 
 
392 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  50.52 
 
 
414 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  51.69 
 
 
396 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.23 
 
 
392 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.84 
 
 
388 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
394 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  49.47 
 
 
382 aa  382  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  50.65 
 
 
392 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  49.49 
 
 
398 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  48.85 
 
 
400 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.89 
 
 
394 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  50 
 
 
398 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 
396 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  49.22 
 
 
393 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  48.06 
 
 
402 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
394 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  48.21 
 
 
396 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  47.49 
 
 
389 aa  363  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.01 
 
 
382 aa  361  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  52.89 
 
 
380 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.7 
 
 
390 aa  358  8e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.44 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  47.78 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  47.78 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  49.87 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  48.08 
 
 
403 aa  349  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  47.56 
 
 
409 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  46.21 
 
 
410 aa  345  6e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  43.16 
 
 
388 aa  345  8e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.31 
 
 
388 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  48.47 
 
 
395 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  46.19 
 
 
404 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  45.53 
 
 
403 aa  342  5e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  47.24 
 
 
404 aa  342  8e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  46.19 
 
 
404 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  46.37 
 
 
405 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  46.37 
 
 
405 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  43.77 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  48.39 
 
 
1135 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  46.41 
 
 
407 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  46.74 
 
 
407 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  46.48 
 
 
407 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  45.43 
 
 
407 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  45.43 
 
 
421 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  45.45 
 
 
404 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  46.48 
 
 
407 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  46.51 
 
 
404 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  46.48 
 
 
407 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  46.48 
 
 
407 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>