More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0100 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 
400 aa  816    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  67.76 
 
 
404 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  67.27 
 
 
396 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  66.32 
 
 
391 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  64.51 
 
 
391 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  65.62 
 
 
389 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  66.06 
 
 
394 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  65.1 
 
 
391 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  65.62 
 
 
389 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.98 
 
 
400 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  62.76 
 
 
393 aa  514  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  65.1 
 
 
389 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  62.24 
 
 
407 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  62.5 
 
 
388 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  61.66 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  63.06 
 
 
399 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  60.05 
 
 
384 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  61.86 
 
 
401 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  61.86 
 
 
401 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.83 
 
 
398 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  60.62 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  63.59 
 
 
401 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  57.92 
 
 
386 aa  461  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  56.66 
 
 
404 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  57.81 
 
 
402 aa  455  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  56.74 
 
 
402 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  58.05 
 
 
397 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  56.92 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  55.98 
 
 
402 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  54.83 
 
 
400 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  53.02 
 
 
388 aa  411  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  54.43 
 
 
400 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  51.93 
 
 
396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  50.9 
 
 
392 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  50.65 
 
 
414 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  52.6 
 
 
387 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  56.92 
 
 
404 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  51.56 
 
 
387 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  51.56 
 
 
388 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  50.26 
 
 
394 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  50.79 
 
 
398 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  51.95 
 
 
400 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  54.31 
 
 
404 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
398 aa  381  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  53.81 
 
 
397 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  49.74 
 
 
399 aa  378  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
394 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  48.82 
 
 
384 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  48.51 
 
 
402 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  50 
 
 
396 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.74 
 
 
392 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
398 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
398 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 
396 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  48.03 
 
 
384 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  49.74 
 
 
398 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.66 
 
 
379 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
390 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  49.09 
 
 
388 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  51.19 
 
 
378 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  51.96 
 
 
407 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  47.63 
 
 
398 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  50.65 
 
 
407 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.83 
 
 
382 aa  365  1e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  49.34 
 
 
396 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  51.71 
 
 
410 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 
394 aa  362  8e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  46.84 
 
 
393 aa  361  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  49.49 
 
 
394 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  48.42 
 
 
404 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  51.81 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.31 
 
 
405 aa  355  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  46.94 
 
 
401 aa  354  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  47.37 
 
 
403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  46.98 
 
 
404 aa  350  3e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  46.49 
 
 
417 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.18 
 
 
436 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.18 
 
 
436 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  48.15 
 
 
380 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  47.92 
 
 
403 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  45.91 
 
 
389 aa  348  8e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  46.35 
 
 
401 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  46.88 
 
 
398 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  47.14 
 
 
403 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  45.66 
 
 
401 aa  346  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.22 
 
 
409 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  45.53 
 
 
382 aa  345  6e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  47.53 
 
 
408 aa  345  8.999999999999999e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  47.14 
 
 
405 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  46.46 
 
 
396 aa  344  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  46.88 
 
 
407 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  46.35 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  47.66 
 
 
407 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  46.61 
 
 
407 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  46.61 
 
 
407 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  46.61 
 
 
407 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  47.14 
 
 
407 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
407 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
407 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  46.09 
 
 
407 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>