More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1607 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  79.38 
 
 		 389 aa  648    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  81.28 
 
 		 391 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  78.21 
 
 		 391 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  83.72 
 
 		 389 aa  680    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  78.87 
 
 		 389 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 388 aa  802    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  85.05 
 
 		 391 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  67.97 
 
 		 393 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  68.59 
 
 		 396 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  66.49 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  65.97 
 
 		 394 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  61.34 
 
 		 407 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  62.5 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  62.66 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  61.1 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  63.54 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  62.2 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.04 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  63.85 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  60.99 
 
 		 399 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  60.52 
 
 		 386 aa  484  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  60.36 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  60.47 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  60.36 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  60.78 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  59.89 
 
 		 402 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  61.98 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  60.21 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  56.74 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  58.33 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  56.92 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  59.74 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  53.59 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  53.85 
 
 		 387 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  53.59 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  53.37 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  55.99 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  56.28 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  56.14 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.96 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  54.74 
 
 		 407 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  54.07 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  49.74 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.06 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.18 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 384 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  48.45 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  48.2 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  48.2 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  49.48 
 
 		 404 aa  365  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.03 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  47.01 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.37 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  48.44 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.55 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.12 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.31 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  49.74 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  47.38 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.1 
 
 		 398 aa  352  7e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.85 
 
 		 386 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  51.08 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  45.67 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  48.1 
 
 		 409 aa  345  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  46.86 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.48 
 
 		 402 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  46.6 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.63 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  47.07 
 
 		 394 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  44.97 
 
 		 382 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.17 
 
 		 388 aa  341  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  46.77 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.33 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.69 
 
 		 382 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  47.84 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.6 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  45.48 
 
 		 401 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.14 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  44.5 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  43.31 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  45.08 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  43.56 
 
 		 403 aa  322  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  48.41 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  43.31 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  44.91 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  44.68 
 
 		 403 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.89 
 
 		 403 aa  318  9e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  44.16 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  43.46 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  44.16 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  44.16 
 
 		 403 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  43.37 
 
 		 502 aa  315  7e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  42.89 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 1135 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  43.08 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>